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SC-PR-HIWATARI-Y-PhysRevE_67_011912.pdf88.57 kBAdobe PDF
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タイトル: Glass transition in an off-lattice protein model studied by molecular dynamics simulations.
著者: Baumketner, A.
Shea, J.E.
Hiwatari, Yasuaki link image
樋渡, 保秋
発行日: 2003年 1月
出版社(者): The American Physical Society
引用: PHYSICAL REVIEW E,67(11),pp.0119121-119126
雑誌名: PHYSICAL REVIEW E,67(11),pp.0119121-119126
ISSN: 15393755
巻: 67
号: 11
開始ページ: 0119121
終了ページ: 119126
抄録: In this paper we report the results of a numerical investigation of the glass transition phenomenon in a minimalist protein model. The inherent structure theory of Stillinger and Weber was applied to an off-lattice protein model with a native state b-sheet motif. By using molecular dynamics simulations and the steepest descent method, sets of local potential energy minima were generated for the model over a range of temperatures. The mean potential energy of the inherent structures allowed to make rough estimates of the glasstransition temperature TK . More accurately TK was computed by direct evaluations of the total and vibrational entropies. It is found that for the present model the thermodynamic ratio of the folding and glass-transition temperatures is 1.7 which is in good agreement with experimental observations.
その他の番号: AA11558033
URI: http://hdl.handle.net/2297/1683
関連URI: http://dx.doi.org/10.1103/PhysRevE.67.011912
資料種別: Journal Article
権利関係: © 2003 The American Physical Society
版表示: publisher
出現コレクション:1.査読済論文(理)

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